釣りタイトルになってしまい、ごめんなさい。結論から言えば私の力（初心者）では Linux 版の JSignPDF では電子署名できませんした。が、ネット上には情報が皆無なので、とりあえず分かったところまで綴ってみます。使用した OS とバージョンは Ubuntu 12.10。

まずは端末を開いて Oracle Java 7 Runtime をインストール。

sudo add-apt-repository ppa:webupd8team/java
sudo apt-get update
sudo apt-get install oracle-java7-installer

次に、サイトから Zip ファイルをダウンロードし、展開。

jsignpdf-1.4.4 の中にある JSignPDF.jar を右クリックで開き「Oracle Java 7 Runtime で開く」で起動。ちなみに OpenJDK Java 7 Runtime では開けませんでした。

と、ここまではわかったのですが、Mac版のときと同様に電子証明書が PKCS12 で読み込めず…。電子証明書をクリックすると Gnome2 KeyStorage か User KeyStorage にインポートできるようですが、どこに格納されているか把握できず…。JKS（Java Key Store）にインストールするのかな？

• Java ™ Cryptography Architecture Sun Providers Documentation
• keytool – Key and Certificate Management Tool

これで電子署名できれば OS もフリーで行けるのに。うーむ（笑）申請用総合ソフトも Wine で動くようにできたら嬉しいんだけど。