先輩から伺いました。株式会社エーアイ・ネットという会社が提供している今昔文字鏡というフォント集になるのかな？ソフトウェア？？かなり昔からあったようで、現在では漢字16万字が扱えるとか。驚愕！
文字鏡研究会もあり、TrueTypeフォントとSVGフォントがダウンロードできるようになっています（注意：フォントのダウンロードについて）
この研究会からだしているパソコン悠悠漢字術今昔文字鏡徹底活用という書籍には11万字が収録されているCDROMが付属しているそうです。お得！
オンライン申請には使えないと思いますが、Wordで申請書を作成するんだったらわざわざ戸籍統一文字情報から引っ張らなくても済むかも。未調査。
申請用総合ソフトも文字鏡フォントサーバみたいなシステムを導入してくれたら申請書がきちんと表示されるから助かるんだけどな。。